基因檢測飛入尋常百姓家
生命基線創(chuàng)立的JanGene(簡基)品牌,是把2C的基因檢測做成了2B(面向企業(yè))業(yè)務,面向企業(yè),為企業(yè)員工提供健康風控服務,側重點是做疾病預防,有相對明確的檢測指標,并結合體檢的數(shù)據(jù)提供有針對性的預防手段,與一些泛娛樂化的互聯(lián)網基因檢測服務有很大區(qū)別。
談到基因檢測,許多人的第一直觀感受就是高大上,九十年代開始,全球六個國家的科學家一起協(xié)作“人類基因組計劃”,這是一項浩大的工程,整個項目花費13年超過30億美金。而現(xiàn)在一個全基因組測序,只需要數(shù)天不到一千美金就可以完成,這就是基因測序領域常說的超摩爾定律,,而這一切源于基因檢測整體技術的進步所致。成本和速度都發(fā)生了天翻地覆的變化,這也讓原本高大上的基因檢測服務飛向了尋常百姓家。
常見的基因檢測服務主要分兩個環(huán)節(jié),一個是采集基因的數(shù)據(jù),一個是解析這些數(shù)據(jù)反應的結果。
第一環(huán)節(jié),凌之浩表示,整體市場上的基因數(shù)據(jù)采集過程都有非常標準化的流程和檢測設備,數(shù)據(jù)的準確程度其實非常高。
第二個環(huán)節(jié)就是要根據(jù)現(xiàn)有的數(shù)據(jù)進行解析,給出分析報告,說明數(shù)據(jù)背后反映的意義。而大多數(shù)疾病的發(fā)生并不完全由基因決定,后天生活環(huán)境也很重要。
基因檢測與基于AWS云計算的數(shù)據(jù)分析
凌之浩介紹說,按照目前的測序技術,要相對完整的覆蓋一個人的全基因組序列,大約需要產出約90G的原始數(shù)據(jù)。而基于這些數(shù)據(jù)的研發(fā)過程,在存儲和計算都需要強大的IT支持。
同一基因位點的變異,在不同人群中的影響可能完全不同,基因信息的解析是否適合服務的人群是一家基因公司最核心的競爭力。為了提升解析的精準度,需要做許多原創(chuàng)性的研究,從凌之浩的介紹中了解到,生命基線科技已與四川大學華西醫(yī)院聯(lián)合申報了原創(chuàng)性的研發(fā)項目,而類似的這種創(chuàng)新合作需要長期堅持才能有所成效。生命基線是在做事業(yè),而不是急于追求商業(yè)上的成功,在產品上,生命基線已經累計了許多知識產權。
除了直接面向企業(yè)提供健康風控服務外,生命基線科技的另一塊業(yè)務叫做“基因幫”,致力解決科研人員在科研過程中各個環(huán)節(jié)的需求,提供基因測序及測序數(shù)據(jù)分析服務??蒲腥藛T在平臺上提交需求,基因幫進行工程師匹配,雙方取得聯(lián)系,明確收費和交付時間。在這個過程中基因幫作為一個第三方平臺,將對項目預付款、項目進度進行把控和監(jiān)管。。
在陸陸續(xù)續(xù)使用了超算和一些云計算平臺后,基因幫最終在半年前選擇了AWS。對于選擇亞馬遜AWS的原因,凌之浩說,一方面是因為成本,一方面是服務。在使用AWS的過程中,公司發(fā)現(xiàn)AWS的服務非常好,24小時有工程師可以解決問題,而且AWS提供的API接口等工具非常便于開發(fā)者去學或者用,上手很快,作為一家創(chuàng)業(yè)公司,AWS的性價比也是他們非常看重的
通過數(shù)百臺Amazon EC2 Spot實例,基因幫獲得所需要的計算能力,使用命令行工具和豐富的API種類,配合EC2,以及啟動腳本來進行快速的部署,利用AWS S3存儲桶來儲存樣本數(shù)據(jù)和最終結果?;驇涂筛鶕?jù)業(yè)務需求自動的進行彈性擴展所需要的實例,可以在 Amazon EC2 Spot實例請求中指定出價,從而選擇愿意為實例支付的每小時價格,這一模式非常適合測試和開發(fā)環(huán)境。
現(xiàn)在幾分鐘就可以部署上百臺服務器實現(xiàn)計算分析任務,并在計算完成后自動關閉實例,極大的降低了運維的壓力。
未來發(fā)展
生命基線的兩大業(yè)務當中,簡基作為新興業(yè)務在定位和內容上都不同于市場常見的2C的基因檢測公司,對企業(yè)員工提供的一系列服務能讓企業(yè)為員工選擇更有針對性的體檢項目,讓員工看到體檢的價值,這點理應受到企業(yè)的歡迎。
面向未來,生命基線給自己的定位是技術服務商,為體檢機構、社區(qū)醫(yī)院等機構提供高質量的基因數(shù)據(jù)分析服務,幫助這些機構為用戶提供更高質量的服務。